莆田市氣象局的前身為福建省閩候專署中心氣象站、福建省閩候專區(qū)氣象區(qū)、福建省閩候專區(qū)氣象臺。1971年7月改稱莆田地區(qū)氣象臺，1983年10月，莆田地區(qū)撤區(qū)建市，莆田市氣象臺成立，下設人秘科、業(yè)務管理科、服務科、天氣預報科。1988年12月，莆田市氣象臺改稱為莆田市氣象局，下設辦公室、人事科、業(yè)務管理科、服務科、天氣預報科。1997年5月機構改革，下設氣象臺、人秘科、科技服務與產業(yè)科。2002年根據(jù)中編制委批復的《地方國家氣象系統(tǒng)機構改革方案》和福建省氣象局批復的《莆田市國家氣象系統(tǒng)機構改革方案》，市氣象局內設參照公務員管理的職能科（室）3個：辦公室（人事科）、業(yè)務科技科、政策法規(guī)科；直屬科級業(yè)務單位4個：莆田市氣象臺、莆田市氣象科技信息服務中心、莆田市防雷中心、莆田市氣候資源開發(fā)中心；并設立仙游縣氣象局、荔城區(qū)氣象局、秀嶼區(qū)氣象局3個縣（區(qū)）級氣象局。1997年5月莆田市機構編制委員會同意成立“莆田市防雷監(jiān)測技術中心”，人員編制核定10名，經費實行自收自支。
1978年底莆田市氣象臺有干部職工35人（含1979年分離出的原莆田縣氣象站人員）?，F(xiàn)有在職人數(shù)35人，大學本科20人，大學?？?SPAN>11人，中專4人，中共黨員18人，共青團員2人。離退休黨員13人。
